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Text File  |  1995-03-04  |  1.9 KB  |  37 lines
  1. *******************************************
  2. * OHHL biosynthesis luxI family signature *
  3. *******************************************
  4.  
  5. N-(3-oxohexanoyl)-L-homoserine lactone (OHHL)  is  a  molecule  produced  by a
  6. number of  gram-negative    bacteria that acts as an autoinducer by binding to
  7. transcriptional regulatory proteins and activating them [1].  OHHL is produced
  8. by a family of related proteins which  is  known as the  luxI family and which
  9. currently consist of the following members:
  10.  
  11.  - luxI from Vibrio fischeri. The target of OHHL is the luxR protein that acts
  12.    in the regulation of bioluminescence genes.
  13.  - carI  from  Erwinia  carotovora. The target of OHHL is carR which activates
  14.    genes involved in the biosynthesis of carbapenem antibiotics.
  15.  - eagI from Enterobacter agglomerans. The target of OHHL is not yet known.
  16.  - expI  from Erwinia carotovora. The target of OHHL is expR which is involved
  17.    in virulence  (soft  rot  disease) by activating the genes for plant tissue
  18.    macerating enzymes.
  19.  - lasI  from  Pseudomonas  aeruginosa.  The  target  of  OHHL  is  lasR which
  20.    activates the transcription of the elastase gene.
  21.  - traI  from  Agrobacterium  tumefaciens.  The  target  of OHHL is traR which
  22.    regulates Ti plasmid transfer.
  23.  
  24. Proteins from  the  luxI family contains from 193 to 217 amino acids. The best
  25. conserved region  is  located  in  the  N-terminal region and can be used as a
  26. signature pattern.
  27.  
  28. -Consensus pattern: L-R-x(3)-F-x(2)-R-x(2)-W-x-[LIVM]-x(6)-E-x-D-x-[FY]-D
  29. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  30. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  31. -Last update: June 1994 / First entry.
  32.  
  33. [ 1] Swift S., Winson M.K., Chan P.F., Bainton N.J., Birdsall M., Reeves P.J.,
  34.      Rees C.E.D., Chhabra S.R., Hill P.J., Throup J.P., Bycroft B.W.,
  35.      Salmond G.P.C., Williams P., Stewart G.S.A.B.
  36.      Mol. Microbiol. 10:511-520(1993).
  37.